圖騰說
原始社會的先民常用某種動物、無生物或自然現象的圖形作為本氏族的保護神和標志，即圖騰。《山海經》諸如人和野獸的混合形象形象就是遠古各地的圖騰神。夏族的圖騰是熊或魚，商族的圖騰是玄鳥，周族的圖騰則有龍、鳥、龜、犬、虎諸說。十二生肖除龍為虛幻之物，其余皆是日常可見。其中可分兩類，即“六畜”（馬牛羊雞狗豬）和“六獸”（鼠虎兔龍蛇猴），前者是人們為了經濟目的而馴養，后者則一定程度騷擾人類生活，先民對其心生畏懼的動物。因此這些動物被作為本氏族的名號標記來崇拜。
民族學者劉堯漢從彝族的圖騰遺跡，反推“十二獸歷”的'來源，桂西彝和毛道彝的十二獸歷法將人與紀歷十二獸同列，“是原始人人獸不分的思想意識在現實的遺留”。至今彝族仍用十二獸歷紀日并用于集市之名（如虎街、兔街）。《史記·五帝本紀》記述黃帝“教熊羆貔貅軀虎，以與炎帝戰于阪泉之野”，文中所言是各部落圖騰，絕非真有降龍伏虎本領。十二生肖來源于原始社會的圖騰崇拜，成令人信服的學說。
外來說
清代趙翼在《陔余叢考》中，“蓋北俗初無所謂子丑寅卯之十二辰，但以鼠牛虎兔之類分紀歲時，浸尋流傳于中國，遂相沿不廢耳”，認定生肖的外來性質。
郭沫若在《釋干支》中，認為生肖源于巴比倫的黃道十二宮，漢代西域諸國仿十二宮而造十二生肖。古希臘、古埃及、巴比倫等古國也有類似的十二生肖，僅動物不同，由此中國的生肖也許并非首創。但秦簡的出土推翻此說，世界各國都有類似的動物崇拜，反加強圖騰說的合理性。
這兩個是我知道的